Salah satu Kelebihan Dosen yang mengajar di Kementerian Agama termasuk didalamnya Perguruan Tinggi Keagamaan Islam Negeri adalah mendapatkan Tunjangan Kinerja. beberapa aturan yang menjadi dasar Tunjangan Kinerja tersebut adalah sebagai berikut:

a. Kelas Jabatan Struktural

b. Kelas Jabatan Fungsional Tertentu seperti Dosen, Pustakawan dan lain-lain.

c. Kelas Jabatan Fungsional Umum